Nach Brügger sind die Ursachen für viele Schmerzzustände im arthromuskulären System weniger auf strukturelle Erkrankungen sondern vielmehr auf Schutzmechanismen des Gehirns zurückzuführen. Einseitiges und fehlerhaftes Beanspruchen von Muskeln, Sehnen und Gelenken im Alltag löst diese Schutzmechanismen aus. Sie führen zu Funktionsstörungen und zu Veränderungen der normalen Bewegungsmuster.

Bei chronischer Fehlbelastung können aus diesen nicht beseitigten Funktionsstörungen strukturelle Veränderungen und Schmerzen entstehen. Das Ziel der Brüggertherapie ist, durch die ausführliche Funktionsanalyse die bestehenden Störfaktoren zu erkennen und zu beseitigen. Die Schulung der aufrechten Körperhaltung ist hierbei ein wesentlicher Bestandteil.